Forscher entwickeln eine neue Methode zur Identifizierung spleißbasierter Biomarker für Leberkrebs

Es hat sich herausgestellt, dass eine neue Methode spleißende Biomarker für Leberkrebs identifiziert hat.

Es hat sich herausgestellt, dass eine neue Methode spleißende Biomarker für Leberkrebs identifiziert hat.

Laut einer Cold Spring Harbor Laboratory-Studie haben Forscher eine Methode zur Identifizierung spleißbasierter Biomarker für die häufigste Form von Leberkrebs, das hepatozelluläre Karzinom (HCC), entwickelt.

Die Forscher um Professor Adrian Krainer hielten die Methode auch für andere Krebsarten für nützlich. Da Leberkrebs besonders vielfältig, genetisch und rückfallgefährdet ist, ist die Identifizierung von Biomarkern, die den Krankheitsverlauf vorhersagen können, ein entscheidendes Ziel im Kampf dagegen.

"Diese Studie unterstreicht das Potenzial zu lernen, wie RNA-Splicing-Varianten zu Krebs beitragen können und weist auf diese Varianten als potenzielle Biomarker für die Krebsentwicklung", sagte Krainer.

Spleißen bezieht sich auf einen Prozess, bei dem eine RNA-Nachricht, die aus einer Information kopiert wurde, die in einem Gen kodiert ist, bearbeitet wird, bevor sie in der Lage ist, als ein Entwurf für die Herstellung eines spezifischen Proteins zu dienen.

Ein Gen kann mehrere RNA-Nachrichten hervorbringen, die jeweils zu einer anderen Proteinvariante oder "Isoform" führen. Viele Krankheiten wurden mit Fehlern oder Variationen in der Art und Weise in Verbindung gebracht, wie RNA gespleißt wird.

Fehler oder Variationen beim Spleißen können zu nichtfunktionellen Proteinen oder Proteinen mit unterschiedlichen oder abweichenden Funktionen führen.

Neuere Studien haben spleißende Unregelmäßigkeiten in Leberkrebszellen identifiziert. Unter Leitung des Forschers Kuan-Ting Lin entwickelte Krainers Team eine Methode, die alle RNA-Botschaften eines bestimmten Gens umfassend analysiert.

Das Team testete ihre Spleißvarianten-Nachweismethode bei HCC durch Analyse von RNA-Botschaften in HCC-Zellen, die von Hunderten von Patienten gesammelt wurden.

Sie fanden heraus, dass bestimmte Spleiß-Isoformen des AFMID-Gens mit einem sehr schlechten Überleben der Patienten korrelierten. Diese Varianten führen Zellen dazu, verkürzte Versionen des AFMID-Proteins herzustellen.

Diese ungewöhnlichen Versionen des Proteins sind mit adulten Leberkrebszellen mit Mutationen in Tumor-Suppressor-Genen, TP53 und ARID1A, assoziiert.

Diese Mutationen, so die Hypothese der Forscher, sind mit geringen Mengen eines Moleküls namens NAD + verbunden, das an der Reparatur beschädigter DNA beteiligt ist.

Das Wiederherstellen fehlender Teile, die Exons genannt werden, zu der normalen RNA-Nachricht von AFMID, die sie vorschlugen, könnte NAD + auf normale Niveaus anheben, wobei Mutationen in TP53 und ARID1A vermieden werden.

Das Team hofft, kleine Moleküle namens ASOs (Antisense-Oligonukleotide) zu verwenden, die an RNA binden können, um die Art und Weise zu ändern, in der AFMIDs RNA-Nachrichten gespleißt werden.

Krainers Team verwendete diese Technik zuvor, um Fehler beim Spleißen des Gens SMN2 als eine Möglichkeit zur Behandlung von spinaler Muskelatrophie (SMA) zu korrigieren.

Das Fixieren von AFMID-Spleißen könnte zu einer verstärkten Produktion von NAD + und einer Erhöhung der DNA-Reparatur führen. "Wenn wir dies tun können, kann AFMID Spleißen ein therapeutisches Ziel und die Quelle eines neuen Medikaments für Leberkrebs werden", sagte Lin.

Die Studie wird in der Zeitschrift Genome Research veröffentlicht.

Dies wird unbearbeitet aus dem ANI-Feed veröffentlicht.

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